1978年11月，中国科学院根据新形势的需要，经协商陕西省委省政府报请国务院批准：成立中国科学院西安分院，地址设在西安市小寨东路3号；2003年3月，地址迁往西安市咸宁中路125号。

1978年2月28日，陕西省科学技术委员会向陕西省委报告，为了贯彻落实《中共中央关于召开全国科学大会的通知》精神，加强对我省综合性科学单位的领导，需尽快成立省科学院，负责管理原省科技局领导的（包括中国科学院在我省的双重领导单位）和即将成立的科研单位，并正式向陕西省委省政府提出成立陕西省科学院的请示[陕科党发（78）009号文件]。1978年3月18日，中共中央召开“全国科学大会”。1978年4月30日，陕西省科学院成立，与中国科学院西安分院合署办公，实行“一套机构，两块牌子”的运行机制。